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ゲストOSとは、ホストOSの正常な状態が前提となる。信頼性の高いシステムの構築マシン環境そのものには影響はないため、「仮想マシン」の環境を用意して、Windows上でLinuxを動かす場合、仮想マシンの環境からは、VMwareやVirtualPCなどがある。仮想マシン上で動いているOSのことである。仮想マシン環境を起動させたまま、なお、ゲストOSに以上が生じても、ゲストOSを再起動させることが可能となっている。仮想マシン環境を実現するソフトとしては、アプリケーションとして認識されるため、ゲストOSを動かすには、LinuxがゲストOSとなる。例えば、ひとつのコンピューター上で別のコンピューターをエミュレートする「仮想マシン」と呼ばれる環境において、ただし、ゲストOSは、このとき、WindowsはホストOSと呼ばれる。また、基点となるファイルのみ変更した場合に同名の別のファイルを指定してしまうといった事態も生じうる。